Czy trzeba zwracać VAT w przypadku otrzymania refundacji zakupu środka trwałego

Czynny podatnik VAT zakupił środek trwały za 100 000 zł. Było to u niego wewnątrzwspólnotowe nabycie towarów, wobec czego w deklaracji VAT wykazał zarówno VAT należny, jak i VAT naliczony. Jednocześnie podatnik zawarł umowę z urzędem pracy na refundację wyposażenia. Otrzymał 44 000 zł refundacji. Urząd pracy chce zwrotu odzyskanego VAT od kwoty refundacji. Podatnik nikomu VAT nie płacił i nic nie odzyskał. Rozliczenie VAT z tytułu WNT wychodzi na 0.

Czy w takiej sytuacji należy zwracać podatek naliczony od wewnątrzwspólnotowego nabycia?