Jak rozliczyć godziny nadliczbowe pracowników tymczasowych?

W naszej firmie pracę wykonywał pracownik tymczasowy w okresie od 1 sierpnia do 4 października br. Pracował w równoważnym systemie czasu pracy, ale zawsze w zamian za pracę w przedłużonym dobowym wymiarze udzielaliśmy mu czasu wolnego. Tymczasem agencja pracy tymczasowej, która go przysłała, wystawiła nam dodatkową fakturę na wynagrodzenie za pracę tego pracownika w godzinach nadliczbowych przekraczających przeciętną tygodniową normę czasu pracy (za 12 godzin). Czy agencja mogła dokonać takiego ustalenia, skoro pracownik tymczasowy nie przepracował okresu rozliczeniowego obowiązującego w naszej firmie (3 miesięcy)?